Check mal den Stecker unter der Ansaugbrücke, der für die Einspritzleiste zuständig ist. Meiner lief auch nicht mehr rund, nachdem ich die Ansauge und Ventildeckel herunten hatte, ich musste feststellen, dass der Stecker keinen richtigen Kontakt gemacht hatte, hab ihn dann ohne den "Blechhalter" dazwischen zusammengesteckt und seit dem Läuft er wieder schön. Hast du den Motor richtig entlüftet, also auch mehrmals, kann sein, dass man nicht alle Luftblasen herausbekommt, sondern erst mal eine Runde fahren muss und dann nochmal entlüften, hatte ich beim ersten mal auch. Evtl. hat das Thermostat auch ne Macke, bei zu hohem Widerstand, zum Beispiel wenn die Führung des Bimetalls verbogen ist, öffnet es zu spät und der Motor wird heiß bevor das Thermostat vollständig öffnen kann. Stottert er beim Hochdrehen, oder besser gesagt, hat er "Drehzahllöcher" wo ihn dann Leistung und Drehmoment schlagartig fehlen? Falls ja, kann das am Kurbelwellensensor ("OT Geber") liegen, da will der Motor dann auch nicht mehr so richtig. Dieser sitz vorne am Motor. Starte mal den Motor und sprühe im Motorraum mal mit Starhilfespray oder Bremsenreiniger etwas herum, wenn sie die Drehzahl ändert, saugt er irgendwo im Motorraum Luft / Falschluft an.