Sehe keine Auswirkungen auf das H-Kennzeichen, da ja auch Umlackierungen H-Kennzeichenfähig sind und es hier um eine BMW-Werks-Farbe geht.
Beim Verkauf: Derjenige mit Ahnung, wird eine Ausstattungsliste via VIN ziehen und eine perlbeige Lederausstattung bei der Besichtigung erwarten. Wenn er dann auch noch richtig Ahnung hat, dann wird ihm eventuell auffallen, dass es nicht perlbeige sondern Natur ist und das als Einfallstor zum Handeln nehmen ... wenn dich einer direkt fragt, ist das perlbeige? und du sagst nicht die Wahrheit, wäre es arglistige Täuschung mit OMG Einfallstor für Rechtsstreitigkeiten.
Klar kann jede Veränderung irgendwelche Auswirkungen haben, aber es geht ja primär darum, wie willst Du höchstpersönlich mit dem Auto die nächsten Jahre herumfahren?
Ich selber bin eher der Typ, möglichst viel Originalsubstanz, wo es Sinn macht und möglich ist, zu erhalten und würde daher auch mit einer patinierten Lederausstattung herumfahren. Andere bauen den Klumpatsch aus und senden ihn nach Polen und sind dann mega happy, mit dem Polenleder, welches in fast allen Fällen nie an die Qualität der alten Ledersorten heranreicht, sondern eher mit dem zu vergleichen ist, was heute in Massenautos verbaut wird. Kann man bei "schwattem" Leder ggf machen, aber bei anderen Farben? Wobei: Auch das neue Leder ist heute oft eher grau als richtig schwarz ...
Am Ende musst Du selber Deine "Philosophie" entwickeln, wie Du mit dem Auto umgehst. Wenn es Dir um Wertanlage geht, dann mach es wie bei Immobilien: NICHTS machen, stehen lassen (beim Auto dann, nichts verändern, außer Standart- Wartungsarbeiten), in 2-3 Jahren verkaufen.